Pues, sinceramente, no sé que decirte .
Creo que el problema reside en que el MSTS está preparado para pantallas wga, pero no para las xwga (las panorámicas) como la de tu máquina. Así, reconoce resoluciones como 1024x768 o 1280x1024 (wga), por eso si le pones 1280x800 te deja los márgenes a los lados. De todas formas, esa resolución que indicas me parece un poco rara (me suena que hay una intermedia para xwga de 11xx X 9xx).
Prueba diferentes resoluciones de pantalla en windows.